Avrupa Birliği Müktesebatına uyum kapsamında yapılan yasal düzenlemelerle Emniyet Genel Müdürlüğü ve taşra güvenlik birimleri tarafından yürütülmekte olan Lozan Antlaşması hükümleri çerçevesinde, azınlığa ait dini, hayri, sıhhi, sosyal, eğitsel ve kültürel müesseseler ile bunların kamu kurum ve kuruluşlarıyla ilgili iş ve işlemlerinin, İçişleri Bakanlığı'nda İller İdaresi Genel Müdürlüğü ve İllerde Valilikler tarafından yürütülmesi uygun görülmüştür.
İstanbul’da, AB ülkelerindeki uygulamalara paralel olarak Azınlıklara ait her türlü iş ve işlemler sivil memurlar aracılığıyla yeni oluşturulan Valilik birimince; Azınlık İşlemleri Bürosunca, yürütülmektedir.