Çocuğun kendi cinsiyetinden inatçı ve şiddetli bir rahatsızlık ve karşı cinsten olmaya özlem duyması (veya karşı cinsten olduğunda ısrar etmeki) ile belirli bozukluklardır. İnatçı biçimde karşı cinsin giysileri veya etkinlikleriile aşırı uğraşma ve kendi cinsiyetini reddetme bulunur. Bu bozuklukların göreceeli olarak nadir olduu düşünülmektedir ve çok daha sık görülen cinsiyet rolü davranışına yineleyici biçimde uymama ile karıştırılmamaladırlar. Çocukluğu cinsel kimlik bozukluğu tanısı normal erkeklik veya kadınlık özelliklerinden çok fazla sapma olmasını gerektirir; kızlarda hafif “erkek Fatmalık” veya erkeklerde “kızsı” davranışların olması yeterli değildir. Kişi ergenliğe eriştikten sonra bu tanı konulmaz.